海商来自东南沿海各省，不同地区，许多团体之间，还存在不可调节的矛盾，想要进行统一的军事行动，就必须要建立临时的统一指挥体制。
由海军都督府，外派三名将领以及大量参谋人员，在浙江、福建、广东三地，组建临时舰队。
海军将领担任主将，由海商推举的领袖担任副将
其中，最为重要和关键的，自然是广东舰队
他们既要向东参与和荷兰舰队会战，又要向西袭击和登陆东南亚沿海，策应明军在陆地上的进攻。
其三，是规范战争中的原则和范围
毕竟这并非是常规武力，而是临时舰队，不可能长期作战，而且其军费也是由各海商自付的，否则真以明廷自己承担这么大规模的舰队开销，那得多少军费，再给海军开两倍都不够。
枢密院海军署给出的规划，是尽量在两个月内，结束战斗
其中，福建舰队主攻，广东舰队、浙江舰队侧击，广东舰队还要负责对东南亚战区的策应。
当然，大明海军应当充当这支庞大舰队的先导和骨干力量。
而且，海军署和郑成功认为
组织这样一支庞大的舰队，看起来好像朝廷一分钱没花，但其实
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