亲军，继而在地方置千户所守备地方，又有了“所“的编制。
在这个过程中，他对手下诸将所部兵员数量核实，统兵5000人者为指挥，统兵1000人者为千户，100人为百户，50人为总旗，10人为小旗。
一方面军官地位的高低，主要据其所拥有军队的多寡；另一方面，以卫、所作为军队的基本编制，以指挥、千户、百户为各级军官的官号，编制划一，名实相副，部伍整齐，这就是所谓的“部伍法”也是大明卫所制度的基本内容。
在对全国兵马进行整编后，终于在洪武七年形成了完备的明朝卫所制度，大抵以5600人为一卫，1120人为一千户所，112人为一百户所，50人为一总旗，10人为一小旗。
一卫辖五个千户所，一个千户所辖10个百户所，一个百户所辖两个总旗，每个总旗设五个小旗。
全国军队均按此编制编入卫所，由小旗、总旗、百户、千户、卫指挥使逐级率领。
至此，卫所制度成为明军的基本编制即成定制，无论是京、省驻军，还是皇帝、藩王的亲军、护军，均按卫所编制。
最早的营兵，其实在明初也有出现，那就是从各卫所抽调的中的精壮，临时组合成战
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